基于线粒体细胞色素b基因序列探讨长江流域斑点蛇(鱼句)种群遗传结构和地理分化

• 作者: 俞丹 刘焕章 唐琼英 李小兵
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑点蛇(鱼句) 长江流域 Cyt b 遗传结构 地理分化
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 251-259
• 页数: 9页
• 分类号: Q111|Q959.4
• 字数: 5658字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20150373

摘要

通过分析303尾来自长江上游赤水河、长江上游干流和长江中游的斑点蛇(鱼句)Saurogobio punctatus线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列,探讨这3个种群的遗传结构及地理分化过程.用于分析的Cyt b基因序列长1 097 bp,含变异位点80个,其中简约信息位点34个.303尾个体共检测到49个单倍型,整体呈现较高的单倍型多样性(Hd=0.803)和较低的核苷酸多样性(Pi=0.003 71).由单倍型构建的系统发育树显示:所有来自长江中游种群的单倍型聚在一起,形成一个单系群,处于系统发育树最进化的位置;来自长江上游干流和赤水河种群的单倍型处于更基部的位置,不能构成单系群.长江上游干流种群与赤水河种群间具有较多的共享单倍型,二者间的遗传分化指数较低(FST=0.029 4),存在广泛的基因交流.而长江中游与长江上游干流及赤水河种群间的FST值分别为0.614 0和0.706 0,暗示长江上游与长江中游的斑点蛇(鱼句)间已发生高度分化.中性检验及错配分析显示,长江上游干流种群及赤水河种群经历过种群扩张,而长江中游种群未检测到扩张.Bayesian skyline plot(BSP)分析显示,斑点蛇(鱼句)种群从距今20万年前开始发生扩张,一直持续到末次间冰期(MIS5)晚期,而后迅速扩张.根据BSP分析及单倍型网络图,推测斑点蛇(鱼句)的起源中心可能在长江上游,然后通过种群扩张逐渐扩散到长江中游,进化成遗传分化较大的种群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李小兵	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	27	87	6.0	7.0
5	刘焕章	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	71	1282	19.0	34.0
6	唐琼英	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	14	244	8.0	14.0
7	俞丹	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	8	29	3.0	5.0