基于线粒体12S rDNA序列分析岩扇贝与国内主要经济扇贝的亲缘关系

• 作者: 付北德 俞小牧 刘阳 周颖 廖德杰 曹善茂 王潇 童金苟
• 来源期刊: 河北渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 12S rDNA 岩扇贝(Crassadoma gigantea) 遗传变异 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究与探讨
• 页码范围: 9-14
• 页数: 6页
• 分类号: Q959
• 字数: 3618字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-6755.2018.02.003

摘要

应用PCR扩增和测序技术获得了引进种岩扇贝(Crassadoma gigantea)及我国主要经济扇贝:虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、栉孔扇贝(Chlamys farreri)和海湾扇贝(Argopecten irradians)的12S rDNA全序列,并进行了相关分析.结果表明,四种扇贝12S rDNA的序列长度在906～964 bp之间,其A+T含量在50.57％～56.77％之间;单倍型数、多态性位点数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数分别在2～3、2～3、0.264～0.623、0.000 75～0.002 07和0.427～1.882之间,均表现出较低的遗传多样性水平;种间遗传距离在0.079～0.306之间,其中虾夷扇贝与栉孔扇贝的遗传距离最近,其次是岩扇贝与虾夷扇贝,而岩扇贝与海湾扇贝的遗传距离最远,并且系统进化树分析结果显示虾夷扇贝先与栉孔扇贝聚为一支,再与岩扇贝进行聚类,而海湾扇贝则与其它扇贝聚为另一个单系群,进一步阐明了四种扇贝间的亲缘关系.