金霉素胁迫下室内粪土模型中菌群多样性与四环素类抗生素耐药基因丰度研究

• 作者: 任海鑫 冯慧君 孙永学 李金红 邹勇 陈永杰 黄蔚虹
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 金霉素 菌群多样性 四环素类抗生素 耐药基因 丰度 日消减率
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 页码范围: 65-73
• 页数: 9页
• 分类号: Q89
• 字数: 4949字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2018.05.010

摘要

[目的]探究金霉素在粪土环境中对土壤微生物群落结构多样性和四环素类耐药基因(TRG)丰度的影响.[方法]分别设置金霉素质量0(对照)、10、100、1 000 μg作为胁迫剂量,在处理后第1、7、14、28、56天采集样品,使用高通量测序和qPCR技术研究群落结构多样性和TRG丰度的变化.[结果]厚壁菌门能耐受低剂量(10 μg)金霉素的毒害作用,对中、高剂量(100、1 000 μg)敏感;放线菌门能耐受中、高剂量的毒害作用,生存繁殖具有一定优势;变形菌门的相对丰度除第28天各剂量组均显著低于对照组外,其余时间多显著高于对照组.金霉素-猪粪-土壤模型样品中共检测出3种四环素类抗生素耐药基因(TRGs):tetO、tetT和tetW,3个基因丰度变化趋势相似:与第1天相比,第56天各组TRGs相对含量均显著减少;低剂量组TRGs相对含量的日消减率在Ⅱ期高于对照组和中、高剂量组,第7天TRGs相对含量显著高于对照组以及中、高剂量组;中剂量组TRGs相对含量的日消减率在Ⅳ期低于其余组,第56天TRGs相对含量显著高于其余组.[结论]在猪粪-土壤环境中,不同菌群对金霉素敏感程度不同,金霉素可改变优势菌群的相对丰度,从而引起菌群群落结构的变化.金霉素可改变TRGs相对含量的日消减率,从而影响TRGs相对含量.本研究可为下一步养殖源性抗菌药物残留的生态风险评估提供一定依据.