赤水河半(鱼)的遗传多样性和种群历史动态分析

• 作者: 于江 刘焕章 曹文宣 朱昕 李文静 王小明 王环珊
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 赤水河 半(鱼) 遗传多样性 种群历史动态 遗传分化
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 106-113
• 页数: 8页
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 5816字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2018.014

摘要

在赤水河的水潦、茅台、二合、太平、赤水市5个样点共采集了168尾半(鱼)Hemiculterella sauvagei,通过线粒体DNA的细胞色素b(Cyt b)基因序列分析了半(鱼)种群遗传多样性和种群历史动态.获得序列长度为1137 bp,其中包含42个变异位点,13个单突变位点,29个简约信息位点.168条序列共检测到38种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.895±0.012和0.00487±0.00695.分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)显示:遗传变异主要来源于种群内部(80.95％).Fst值统计表明,赤水市种群与茅台、二合、水潦种群之间存在高度分化,与太平镇种群之间存在中度分化,其他种群之间无显著差异,这表明分布在赤水市和其他4个地理种群的半(鱼)应作为不同的管理单元(MU)进行保护.Mega 6.0软件计算5个种群之间的平均净遗传距离范围为0.004—0.006.中性检验结果为水潦、太平和赤水市的Fs值为负值,表明这3个地理种群的半(鱼)曾发生过种群扩张.采用1％per Myr的突变速率推算出半(鱼)水潦种群扩张时间大约在0.43百万年前,太平镇种群大约在0.40百万年前,赤水市种群大约在0.37百万年前.