临床分离变形杆菌不典型第1类整合子结构分析

• 作者: 刘维薇 李万翔 肖林林 胡庆丰 魏取好
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 整合子 基因盒 反向PCR 耐药性 变形杆菌
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 微生物学
• 页码范围: 440-445
• 页数: 6页
• 字数: 4950字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2018.06.007

摘要

目的 确定临床分离变形杆菌中不典型第1类整合子的结构.方法 在26株第1类整合酶基因阳性可变区扩增失败的变形杆菌临床分离株中,选取6株通过反向PCR扩增第1类整合酶基因周围DNA片段,PCR产物测序结果通过BLAST进行比对分析,确定同源目标序列后,查看GenBank该提取码对应序列文件靶序列周围序列,再根据周围序列设计合成引物进行重叠PCR并测序验证.结果 通过反向PCR及重叠PCR测序分析,26株变形杆菌临床分离株中,25株细菌第1类整合子可变区结构全部或部分确定,其中22株细菌第1类整合子可变区结构为estX-psp-aadA2-cm-lA1-aadA1a-qacI-tnpA-sul3,另3株第1类整合子可变区分别为estX-psp-aadA2-cmlA1、dfrA14、IS26,均缺失3′保守区.结论 反向PCR可用于临床菌株中不典型第1类整合子结构分析,在临床分离变形杆菌中首次检出基因盒 psp 及基因盒组合 estX-psp-aadA2-cmlA1-aadA1a-qacI-tnpA-sul3、 estX-psp-aadA2-cmlA1.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡庆丰	浙江省人民医院检验中心	92	475	12.0	17.0
2	肖林林	上海市奉贤区中心医院检验科	3	5	2.0	2.0
6	李万翔	浙江省人民医院检验中心	5	7	2.0	2.0
7	刘维薇	同济大学附属上海市第十人民医院检验科	13	59	4.0	7.0