HLA基因分型质控体系的建立及其关键的质控点

• 作者: 徐筠娉 洪文旭 聂冬梅 邓志辉 高素青
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 关键词: 人类白细胞抗原 基因测序 单核苷酸多态性 质量控制
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 324-328
• 页数: 5页
• 字数: 2599字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2018.03.004

摘要

目的 探讨HLA-A、B、C、DRB1和DQB1等位基因分型的关键质控点,探讨组织配型实验中关键质控点的配置方案,以提高HLA分型的准确性.方法 应用PCR-直接测序分型(PCR sequence-based typing,PCR-SBT)法,对10 167例随机健康献血者和组织配型供、受者的全血样本HLA-A、B、C基因的第2～4外显子,DRB1基因的第2外显子,DQB1基因的第2、3外显子进行测序分型.应用PCR序列特异性寡核苷酸探针法对56例正、反向序列不一致的样本进行复核.对不能与IMGT/HLA数据库中已知等位基因匹配的单核苷酸序列进一步作克隆测序分析.针对关键质控点设计控制机制.结果 在10 167例样本中,共检出HLA-A、B、C、DRB1和DQB1新等位基因8个,绘制出在分析常见HLA等位基因时容易误读的单核苷酸多态性位置表,其中HLA-A位点3个、B位点8个、C位点6个、DRB1位点4个、DQB1位点6个.在关键质控点设置措施中,样本编号的唯一性及实验过程中DNA的转管应当被重视.结论 在HLA基因分型工作中,核对两个等位基因间差异的单一核苷酸和关键控制点,可确保HLA分型结果的准确性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓志辉		37	118	7.0	9.0
3	聂冬梅		11	64	3.0	8.0
5	高素青		20	52	4.0	7.0
7	徐筠娉		9	6	1.0	1.0
9	洪文旭		7	2	1.0	1.0