数据挖掘分析线粒体转录延伸因子在 胰腺癌中的表达及意义

• 作者: 孙美涛 张晓娟 李素芬 梅雯 熊伟 王唯斯 自加吉
• 来源期刊: 井冈山大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 胰腺癌 线粒体转录延伸因子 数据挖掘
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 38-43
• 页数: 6页
• 分类号: R735.9
• 字数: 3383字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8085.2018.05.008

摘要

线粒体转录延伸因子(mitochondrial transcription elongation factor,TEFM)在线粒体基因转录调控中发挥重要作用,但其在胰腺癌中的表达及意义未见系统研究.本研究利用各种肿瘤生物信息学数据库进行数据挖掘分析TEFM基因在胰腺癌及正常胰腺组织中的表达情况,并进一步探讨TEFM基因对胰腺癌患者预后的影响.利用Oncomine数据库分析TEFM基因在正常胰腺组织和胰腺癌组织中mRNA水平的表达变化.通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)人体正常组织和其相应的肿瘤组织中TEFM基因的表达差异.经MethHC分析胰腺癌和正常胰腺组织中TEFM基因DNA启动子区甲基化水平的差异.利用OncoLnc对TEFM基因的表达水平与胰腺癌患者生存率作Kaplan-Meier生存分析和Log-rank检验.在String-DB数据库中探索TEFM基因在线粒体基因转录调控中相互作用的基因.结果显示:与正常胰腺组织相比,胰腺癌组织中TEFM基因在mRNA水平呈高表达,且TEFM基因DNA启动子区甲基化水平升高.TEFM基因的表达水平与胰腺癌患者的总体生存时间无显著相关性.线粒体RNA聚合酶(mitochondrial RNA polymerase,POLRMT)与TEFM蛋白有明显的相互作用.大样本数据挖掘能迅速地获取胰腺癌组织中TEFM基因表达的相关信息,为深入研究TEFM基因在胰腺癌发生发展中的作用机制奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张晓娟	大理市第一人民医院呼吸内科	19	78	5.0	8.0
2	熊伟	大理大学基础医学院	54	97	6.0	8.0
3	孙美涛	大理大学基础医学院	27	57	4.0	6.0
5	梅雯	大理大学基础医学院	26	43	3.0	6.0
6	自加吉	大理大学基础医学院	27	28	2.0	4.0
7	王唯斯	大理大学基础医学院	23	8	2.0	2.0
8	李素芬	大理大学基础医学院	11	4	1.0	1.0