大口黑鲈肌球蛋白重链基因SNPs的筛选及与生长性状的关联

• 作者: 姜鹏 朱新平 李胜杰 李锐 樊佳佳 白俊杰
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大口黑鲈 肌球蛋白重链基因 单核苷酸多态性标记(SNP) 生长性状 关联分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 305-313
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|S917.4
• 字数: 5224字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20170310750

摘要

肌球蛋白是肌肉细胞的重要组成成分,影响肌纤维的组成和肌肉生长.为了研究肌球蛋白重链(MYH)基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性,本研究采用PCR技术扩增得到编码区序列全长为9759 bp的大口黑鲈MYH基因,该基因包含37个外显子和36个内含子,编码1940个氨基酸.采用直接测序法在MYH基因上筛选到8个单核苷酸多态性标记(SNP)位点(A-305G、G-558C、A-2784C、A-2816G、T-4765A、C-6206T、C-6811T和G-6935T),有4个位于外显子上,其中2个属于同义突变.用SNaPshot方法对从同批繁殖、同塘养殖的大口黑鲈"优鲈1号"群体中随机选取的430尾个体中各位点的基因型进行检测.结果显示,内含子上的A-2784C和A-2816G位点完全连锁,所有位点在大口黑鲈"优鲈1号"群体中的平均有效等位基因数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为1.635、0.406和0.373,仅C-6206T、C-6811T和T-4765A位点的基因型频率分布符合Hardy-Wein-berg定律.采用一般线性模型分析各位点与大口黑鲈生长性状之间的相关性,研究发现, C-6811T位点CC基因型个体的体质量和全长显著大于TT基因型,CC基因型个体的体高和尾柄长显著大于CT和TT基因型,其余位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异.C-6811T位点与生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助育种的候选标记.