尼罗罗非鱼Ikaros基因的克隆及表达分析

• 作者: 刘志刚 卢迈新 可小丽 张德锋 曹建萌 朱华平 王淼 衣萌萌 陈昆平 高风英
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 尼罗罗非鱼 Ikaros基因 mRNA剪接异构体 无乳链球菌 表达
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 77-85
• 页数: 9页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 7493字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2018.010

摘要

为揭示尼罗罗非鱼Ikaros基因结构特征及其在抗病原感染中的免疫调控机制,实验采用RT-PCR和RACE方法克隆了尼罗罗非鱼Ikaros的cDNA序列以及利用PCR和染色体步移技术克隆了Ikaros的基因组DNA序列,通过荧光定量PCR分析了Ikaros mRNA的组织分布及其对无乳链球菌感染的响应.结果表明,克隆的尼罗罗非鱼Ikaros基因组DNA为20454 bp,包括7个内含子和8个外显子,经可变剪接可形成6种不同的mRNA剪接异构体,其编码的氨基酸序列均具有Ikaros家族典型的锌指结构域且与硬骨鱼类Ikaros氨基酸序列同源性较高(70.6％—93.7％).Ikaros基因在尼罗罗非鱼各组织中均有表达,在血液中的表达量最高,其次为胸腺、脾脏和头肾.人工感染无乳链球菌后,血液、胸腺、脾脏、头肾中Ikaros基因的相对表达量均显著上调,并在48h达到峰值,这表明Ikaros基因参与调控尼罗罗非鱼抵御无乳链球菌的免疫应答反应.研究可为进一步探索Ikaros基因在罗非鱼抗病原感染中的作用机制奠定理论基础.