玉米自交系X178、掖478授粉前后miRNA表达差异分析

• 作者: 张从省 杨海龙 王宏伟 王琳琳 谢传晓 赵永平
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 microRNA 深度测序 RNA seq 差异分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源
• 页码范围: 30-36
• 页数: 7页
• 分类号: S513.035.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13597/j.cnki.maize.science.20180505

摘要

基于HiSeq高通量测序技术并结合生物信息学方法对X178、掖478两种材料授粉前后两个时期穗已知miRNA及靶基因进行分析.结果发现,X178授粉前后差异表达miRNA有100个,分别属于21个miRNA家族;掖478授粉前后共筛选出98个有差异的miRNA,分别属于22个miRNA家族.利用miRNA与靶基因mRNA负调控关系初步确定授粉前后miRNA可能调控的mRNA靶点,建立miRNA-靶mRNA一一对应关系.结果表明,X178中上调表达的13个miRNA对应11个下调表达靶基因,下调表达的33个miRNA对应41个上调表达靶基因;掖478中上调表达的5个miRNA对应7个下调表达靶基因,下调表达的28个miRNA对应33个上调表达靶基因,其中,6个miRNA家族共靶向11种mRNA.研究结果表明,在授粉前后玉米穗中已知miRNA在不同玉米自交系中种类具有差异.