乳腺癌差异表达miRNA在预后中的意义

• 作者: 何浪 马跃 高英静
• 来源期刊: 医学研究杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺癌 预后 microRNAs 调控网络 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 39-44
• 页数: 6页
• 分类号: R730.3
• 字数: 3464字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2018.01.011

摘要

目的 运用生物信息学方法研究复发转移乳腺癌组织中的差异表达MicroRNAs,预测其在乳腺癌预后中的分子调控网络.方法 从GEO数据库中获取乳腺癌组织MiRNA表达谱,包括131例10年内无远处转移复发者,79例10年内有复发者.GEO2R在线分析工具筛选差异表达MiRNA,靶基因预测验证数据库预测miRNA靶基因,使用DAVID 工具的基因功能注释和通路富集方法对靶基因进行分析.TF-miRNA调控数据库寻找其上游转录因子,Cytoscape软件构建互作网络.结果 复发转移组乳腺癌组织共筛选到差异表达的miRNA 5个,其中表达上调3个,表达下调2个.得到4个相关上游转录因子HIF1A、EGR1、FOXM1、ESR2,与差异miRNA共调控154个的靶基因.靶基因功能集中在BMP信号通路,TGF-p信号通路,细胞骨架组装功能和Rho GTPases信号通路.结论 差异性表达的miRNA包括hsa-miR-210、hsa-miR-33a、hsa-miR-32、hsa-miR-135a、hsa-miR-30a-3p,利用生物信息学方法,能够有效获取信息,为乳腺癌的治疗及预后监测的新策略研究开辟新思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何浪	成都医学院生物医学系	40	149	7.0	11.0
2	马跃	成都医学院基础医学院	1	1	1.0	1.0
3	高英静	成都医学院基础医学院	1	1	1.0	1.0