高通量转录组测序初步研究结肠直肠癌新辅助治疗敏感性

• 作者: 吴浩旋 季晓频 张弢 程兮 赵任 陈献则
• 来源期刊: 外科理论与实践
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠直肠癌 新辅助治疗 治疗敏感性 转录组测序
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 67-71
• 页数: 5页
• 分类号: R735.3+5|R735.3+7
• 语种: 中文
• DOI: 10.16139/j.1007-9610.2018.01.015

摘要

目的:采用高通量转录组测序技术,通过生物信息学手段,初步筛选并鉴定结肠直肠癌病人术前新辅助治疗效果相关基因,并进行差异表达分析,为进一步阐明结肠直肠癌新辅助治疗敏感性的分子机制提供基础.方法:22例接受标准术前新辅助治疗的结肠直肠癌病人,根据肿瘤消退评级分为敏感组9例,不敏感组13例.提取肿瘤组织RNA,构建转录组文库,采用高通量测序平台进行测序.结合生物信息学等相关手段,筛除错误发生率(＜0.05)的基因后对比组装,对得到的转录组样本进行分类和注释.对差异表达基因特征进行分析.结果:初步建立结肠直肠癌新辅助治疗敏感性基因数据库.从22例转录组标本中,发现89个基因表达出现显著上调,112个基因出现显著下调.结论:高通量测序分析提示,这些基因表达变化可能与结肠直肠癌新辅助治疗敏感性密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵任		74	232	9.0	11.0
2	张弢		12	60	6.0	7.0
3	程兮		7	0	0.0	0.0
4	季晓频		11	27	3.0	5.0
5	陈献则		3	0	0.0	0.0
6	吴浩旋		3	0	0.0	0.0