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斑蝥素酸镁对人肝癌细胞株SMMC-7721转录组的影响
斑蝥素酸镁对人肝癌细胞株SMMC-7721转录组的影响
作者:
刘云
刘流
晏容
李晓飞
王灵军
谭香玉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
斑蝥素酸镁
肝癌细胞SMMC-7721
转录组
差异表达基因
RNA-seq
摘要:
目的 通过RNA-seq分析斑蝥素酸镁对肝癌细胞转录组的影响,为阐明斑蝥素酸镁对肝癌细胞增殖的抑制效应提供分子信息,以期为临床上利用斑蝥素酸镁治疗肝癌提供相关理论基础.方法 体外培养的肝癌细胞株SMMC-7721,用不同浓度(0、0.895、1.790、2.685 μmol/L)的斑蝥素酸镁干预48 h后,利用MTT检测细胞抑制率;采用illumina Hiseq2500测序平台对1.790μmol/L处理组和对照组(0μmol/L)进行RNA-seq分析;根据RNA-seq结果,利用qRT-PCR检测了磷脂酰肌醇-3-羟激酶(PI3K)、蛋白激酶B(Akt)、细胞外信号调节激酶1/2(ERK1/2)等基因的表达水平.结果 不同浓度(0.895、1.790、2.685 μmol/L)的斑蝥素酸镁干预48 h后,与对照组(0μmol/L)比较,均能显著抑制SMMC-7721细胞增殖(t=33.48、90.30、151.01,P<0.01).通过RNA-seq分析,斑蝥素酸镁干预后,共导致150个基因表达发生显著变化,82个基因显著下调(P<0.01),68个基因显著上调(P<0.01),这些差异基因涉及Ribosome、Hippo signaling pathway、MAPK signaling pathway、PI3K signaling pathway、mTOR signaling path-way等通路,影响肝癌细胞的增殖、代谢及凋亡;通过qRT-PCR检测,1.790 μmol/L斑蝥素酸镁能够显著降低PI3K、Akt及ERK1/2的转录水平,抑制细胞增殖.结论 通过RNA-seq检测及分析,PI3K、AKT和ERK信号通路的抑制可能在斑蝥素酸镁抑制肝癌细胞增殖中发挥作用.
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小分子干扰
基因沉默
内容分析
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引文网络
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内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名
斑蝥素酸镁对人肝癌细胞株SMMC-7721转录组的影响
来源期刊
中成药
学科
医学
关键词
斑蝥素酸镁
肝癌细胞SMMC-7721
转录组
差异表达基因
RNA-seq
年,卷(期)
2018,(3)
所属期刊栏目
科研报道
研究方向
页码范围
691-695
页数
5页
分类号
R966
字数
3382字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-1528.2018.03.037
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
刘云
遵义医学院基础医学院
51
192
8.0
11.0
5
晏容
遵义医学院基础医学院
47
218
9.0
12.0
9
刘流
遵义医学院基础医学院
36
138
5.0
9.0
10
王灵军
遵义医学院基础医学院
15
35
4.0
5.0
11
谭香玉
遵义医学院基础医学院
1
3
1.0
1.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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共引文献
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(24)
节点文献
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同被引文献
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节点文献
斑蝥素酸镁
肝癌细胞SMMC-7721
转录组
差异表达基因
RNA-seq
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中成药
主办单位:
国家食品药品监督管理局
信息中心中成药信息站
上海中药行业协会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-1528
CN:
31-1368/R
开本:
大16开
出版地:
上海市黄浦区福州路(近江西中路)107号206室
邮发代号:
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
13678
总下载数(次)
5
总被引数(次)
151115
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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