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摘要:
目的 通过RNA-seq分析斑蝥素酸镁对肝癌细胞转录组的影响,为阐明斑蝥素酸镁对肝癌细胞增殖的抑制效应提供分子信息,以期为临床上利用斑蝥素酸镁治疗肝癌提供相关理论基础.方法 体外培养的肝癌细胞株SMMC-7721,用不同浓度(0、0.895、1.790、2.685 μmol/L)的斑蝥素酸镁干预48 h后,利用MTT检测细胞抑制率;采用illumina Hiseq2500测序平台对1.790μmol/L处理组和对照组(0μmol/L)进行RNA-seq分析;根据RNA-seq结果,利用qRT-PCR检测了磷脂酰肌醇-3-羟激酶(PI3K)、蛋白激酶B(Akt)、细胞外信号调节激酶1/2(ERK1/2)等基因的表达水平.结果 不同浓度(0.895、1.790、2.685 μmol/L)的斑蝥素酸镁干预48 h后,与对照组(0μmol/L)比较,均能显著抑制SMMC-7721细胞增殖(t=33.48、90.30、151.01,P<0.01).通过RNA-seq分析,斑蝥素酸镁干预后,共导致150个基因表达发生显著变化,82个基因显著下调(P<0.01),68个基因显著上调(P<0.01),这些差异基因涉及Ribosome、Hippo signaling pathway、MAPK signaling pathway、PI3K signaling pathway、mTOR signaling path-way等通路,影响肝癌细胞的增殖、代谢及凋亡;通过qRT-PCR检测,1.790 μmol/L斑蝥素酸镁能够显著降低PI3K、Akt及ERK1/2的转录水平,抑制细胞增殖.结论 通过RNA-seq检测及分析,PI3K、AKT和ERK信号通路的抑制可能在斑蝥素酸镁抑制肝癌细胞增殖中发挥作用.
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文献信息
篇名 斑蝥素酸镁对人肝癌细胞株SMMC-7721转录组的影响
来源期刊 中成药 学科 医学
关键词 斑蝥素酸镁 肝癌细胞SMMC-7721 转录组 差异表达基因 RNA-seq
年,卷(期) 2018,(3) 所属期刊栏目 科研报道
研究方向 页码范围 691-695
页数 5页 分类号 R966
字数 3382字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-1528.2018.03.037
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘云 遵义医学院基础医学院 51 192 8.0 11.0
5 晏容 遵义医学院基础医学院 47 218 9.0 12.0
9 刘流 遵义医学院基础医学院 36 138 5.0 9.0
10 王灵军 遵义医学院基础医学院 15 35 4.0 5.0
11 谭香玉 遵义医学院基础医学院 1 3 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
斑蝥素酸镁
肝癌细胞SMMC-7721
转录组
差异表达基因
RNA-seq
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中成药
月刊
1001-1528
31-1368/R
大16开
上海市黄浦区福州路(近江西中路)107号206室
1978
chi
出版文献量(篇)
13678
总下载数(次)
5
总被引数(次)
151115
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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