家蚕orcokinin基因的选择性剪接与表达分析

• 作者: 夏定国 沈兴家 王平阳 裘智勇 赵巧玲
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: BmOK基因 选择性剪接 神经肽 家蚕
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 849-858
• 页数: 10页
• 分类号: S881.2|Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.13441/j.cnki.cykx.2018.06.005

摘要

Orcokinin (OK)是节肢动物门特有的一种神经肽,该神经肽自从在小龙虾中发现以来,便陆续在节肢动物门其他物种中鉴定到,然而由于其结构的复杂性和功能的多样性,对OK基因的结构与作用机制知之甚少.利用RACE克隆、qRT-PCR等方法对家蚕OK基因(BmOK)的结构与表达进行分析.结果表明BmOK存在选择性剪接,形成2个转录本BmOKA和BmOKB;BmOKA由外显子exon1、exon2、exon3、exon5、exon6、exon7和exon8组成,全长BmOK由外显子exon1、exon2、exon3和exon4组成.BmOKA由于选择性剪接又有4个亚型,分别为BmOKA1(CDS长度为534 bp)、BmOKA2(CDS长度为564 bp)、BmOKA3(CDS长度为570 bp)和BmOKA4(CDS长度为600 bp),占比为22∶13∶5∶1,4个亚型有相同的5'UTR(62 bp)和3'UTR(188bp);BmOK只有一种CDS(864 bp),5'UTR序列与BmOKA相同(62 bp),但3'UTR(168 bp)不同.BmOKA主要在家蚕腹神经索表达,在4龄眠后18h表达量最低;BmOKB在头部和中肠的表达量相对较高,眠期表达量高于其他时期.BmOKA与斜纹夜蛾Orcokinin同源性最高,完整蛋白质前体的同源性为33.80％.本研究清晰地展示了家蚕BmOK基因的结构与表达模式,为后续分析BmOK基因的功能奠定了理论基础并提供实验依据.