羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析

• 作者: 刘书 刘公社 刘盼盼 李晓霞 杨伟光 齐冬梅
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 羊草 种子萌发 变温 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 58-66
• 页数: 9页
• 字数: 6625字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2017502

摘要

前期实验表明,变温处理(28℃12 h/16℃12 h)可显著提高羊草种子的萌发率,且羊草种子萌发中的第1天是接受变温信号的关键时期.以此为研究基础,结合羊草种子变温萌发的转录组测序数据,针对羊草种子萌发初期对变温处理的响应筛选出与种子萌发、休眠及低温相关的基因24个,利用测序结果中这些基因的RPKM值制作基因表达热图并分析其表达差异.以萌发率高、低的两种羊草种质的种子为材料,对24个基因在恒温12 h(28℃)和变温1 d(28℃12 h/16℃12 h)萌发处理中的表达分别进行了定量分析.结果表明,与恒温对照相比,变温处理12 h后,表达明显上调的基因有SAIN1,PP2C62,EXPB3,EXPB4,GA3ox,EXPA2和EXPA7,而表达明显下调的基因有bHLH49,GID1,ABI8,Chi1,11833,CBF3,NAC2,PP2C72,SAIN2和5423.通过进一步分析相关基因在高、低萌发率两个种质中表达的差异,筛选出其中可能与羊草种子萌发相关的基因有几丁质酶基因Chi1,转录因子基因CBF3,羊草新基因5423,赤霉素合成基因GA3ox,细胞松弛素蛋白基因EXPB4和羊草新基因SAIN1,将为下一步阐明羊草种子萌发的分子作用机理奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘公社	中国科学院植物研究所	49	1310	21.0	35.0
2	齐冬梅	中国科学院植物研究所	20	699	14.0	20.0
3	李晓霞	中国科学院植物研究所	38	299	11.0	13.0
4	杨伟光	中国科学院植物研究所	69	168	6.0	9.0
7	刘盼盼	中国科学院植物研究所	2	25	1.0	2.0
11	刘书	中国科学院植物研究所	1	1	1.0	1.0