杏扁PaCBF1基因的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 王宝地 王连荣 薛拥志
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杏扁 PaCBF1 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 58-64
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S662.03
• 字数: 4111字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.02.009

摘要

CBF转录因子在多种植物的非生物逆境环境中起着重要的作用,可提高植物的抗逆性.为研究CBF基因在杏扁非生物逆境中的作用与功能,以杏扁品种围选1号为试验材料,利用RT-PCR技术克隆了1个CBF/DREB1转录因子基因CBF,命名为PaCBF1,GenBank登录号为MF491392.对其进行生物信息学分析,结果显示:该基因开放阅读框长度为723 bp,编码240个氨基酸,分子量为26.928 ku,等电点为6.35,亲水性平均值为-0.555;PaCBF1蛋白含有一个高度保守的AP2结构域,以及植物CBF蛋白的保守结构域PKKRAGRRVFKETRHP和DSAWR;二级结构预测显示该蛋白主要由38.75%的无规则卷曲、29.58%的α-螺旋、22.92%的延伸链和8.75%的β-转角组成;三级结构的预测结果显示含有α-螺旋、β-折叠和β-转角;该蛋白定位在细胞核,不存在信号肽序列,为非分泌性亲水蛋白,共含有13个磷酸化位点.结果为今后进一步深入研究杏扁CBF转录因子的功能以及对逆境环境的抵抗机制提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王连荣	河北北方学院园艺系	19	151	7.0	12.0
2	王宝地	河北北方学院理学院	17	17	2.0	3.0
3	薛拥志	河北北方学院动物科技学院	16	56	5.0	7.0