大豆和百脉根古老原核基因的全基因组鉴定与比较分析

• 作者: Ndayambaza Boniface 刘文献 张正社 李昱 王彦荣 金小煜 闵学阳 韦兴燚
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 大豆 百脉根 古老原核蛋白 进化
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 49-57
• 页数: 9页
• 字数: 6992字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2017521

摘要

在漫长的进化过程中,高等真核生物从原核生物中获取了大量基因,对这些基因进行鉴定分析,可为研究高等植物系统演化及基因组水平比较分析提供理论依据.为了进一步解析大豆和百脉根古老原核基因在其基因组中所起的作用及进化关系,本研究利用生物信息学技术对大豆和百脉根基因组古老原核基因进行全基因组鉴定,并对其特征及功能进行了比较分析.研究结果表明,大豆(40.6％)古老原核基因的占比高于百脉根(33.9％),且多分布于内共生细胞器线粒体、叶绿体中.此外,古老原核蛋白质的结构域在大豆和百脉根基因组中的分布相似,表明其在大豆和百脉根进化过程中具有较高的共线性和保守性.通过GO注释发现大豆与百脉根中古老原核蛋白主要分布在膜系统、细胞、细胞组分中.在分子功能上,大豆古老原核蛋白更多地参与代谢和发育过程,这可能与其接受了更多的人为选育有关.在生物过程中,古老原核蛋白更多参与催化反应和结合反应,主要以酶的形式在发挥作用.通过比较分析,本研究揭示了古老原核蛋白在大豆和百脉根中进化的独特模式,可为其他豆科植物基因组分析提供一定理论基础.