茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析

• 作者: 张玥 林金科 柯子星 王树茂 胡雲飞
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 儿茶素 MYB转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 162-173
• 页数: 12页
• 分类号: S571.1|Q946.8
• 字数: 5760字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-369X.2018.02.007

摘要

从茶树(Camellia sinensis)转录组数据库中获得6个与儿茶素合成相关的MYB转录因子,对其进行蛋白理化性质与结构功能预测、核定位信号和蛋白保守结构域分析,通过同源分析构建系统发育树.结果表明,与儿茶素合成相关的6个MYB蛋白都属于亲水性的非分泌蛋白,定位在叶绿体、线粒体和细胞核上,其空间结构主要是 α-螺旋和 β-转角;保守结构域的分析发现除了 comp159173_c0基因,其余5个都属于SANT超家族基因成员.系统进化树显示6个MYB蛋白形成4个分支,显示出各自间较远的亲缘关系.差异表达分析的结果进一步证实了6个MYB转录因子与儿茶素合成代谢的相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林金科	福建农林大学安溪茶学院	55	451	11.0	20.0
2	张玥	福建农林大学安溪茶学院	12	6	2.0	2.0
3	胡雲飞	福建农林大学安溪茶学院	4	3	1.0	1.0
4	王树茂	福建农林大学安溪茶学院	2	1	1.0	1.0
5	柯子星	福建农林大学安溪茶学院	6	1	1.0	1.0