克氏光唇鱼线粒体基因组测定及光唇鱼属的系统发育分析

• 作者: 唐文乔 宋小晶 张亚 杨杨
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 克氏光唇鱼 线粒体基因组 系统发育 光唇鱼属
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 207-219
• 页数: 13页
• 分类号: Q959
• 语种: 中文
• DOI: 10.13859/j.cjz.201802006

摘要

根据侧条光唇鱼(Acrossocheilus parallens)线粒体基因(mtDNA)序列设计引物,采用引物步移和PCR扩增产物测序,获得了克氏光唇鱼(A.kreyenbergii)的mtDNA全序列.结构分析表明,克氏光唇鱼mtDNA为首尾闭合的环状基因,全长16596bp,编码37个基因,包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和两段非编码区(D-loop和轻链复制起点OL),碱基组成具有明显的A+T偏好和反G偏倚现象.13个蛋白编码基因中,除CO Ⅰ的起始密码子是GTG,其余基因的起始密码子均为ATG;终止密码子包括完全的终止密码子TAA (38.46％)和TAG (7.69％),不完全的终止密码子TA (15.38％)和T(38.46％).在D-loop区的811～837bp区间发现了一段“TA”短串联重复序列.从蛋白编码基因所包含的信息量、变异位点和变异率看,ND5、ND4、CO Ⅰ和ND2最适合作为光唇鱼属种间系统发育分析的分子标记.采用贝叶斯法利用13个蛋白编码基因所构建的系统发育树显示,光唇鱼属和白甲鱼属(Onychostoma)的24种鱼类各自没有聚为单系群,相互间不能明确区分.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨杨		25	193	6.0	13.0
2	唐文乔		65	364	10.0	16.0
3	宋小晶		3	11	2.0	3.0
4	张亚		14	42	4.0	5.0