棉花细胞质雄性不育恢复基因Rf1候选区域SSCP标记开发与候选基因表达分析

• 作者: 乔秀琴 刘利彩 吴建勇 唐会妮 张学贤 戚廷香 王海林 邢朝柱 郭立平
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 恢复基因Rf1 遗传定位 PPR基因 SSCP标记
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 12-20
• 页数: 9页
• 分类号: S562.03|S321.8
• 字数: 4637字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/1002-7807.llcxcz.20180104

摘要

[目的]棉花细胞质雄性不育恢复基因Rf1的定位对于研究恢复基因的作用机制和改良恢复系具有重要意义.前期研究结果表明在恢复基因Rf1所在Scaffold 333上的目标区间内有9个PPR(Pentatricopeptide repeat)基因成簇分布在160 kb区间内,此区间内还包括另外9个其他类型的基因.为进一步丰富恢复基因目标区域内标记数目,并了解相关基因的表达模式.[方法]利用这18个基因的序列设计出覆盖全部基因的引物共155对,通过单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)技术对可育池和不育池进行筛选,利用荧光定量聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)对目标区域内的8个非PPR基因在不育系、保持系、恢复系的花蕾不同发育时期的表达模式进行了分析.[结果]共得到15对多态性引物,结合前期的3个简单重复序列标记(Simple sequence repeats,SSR)标记对F2群体进行基因型分析,结果表明这些标记分布在4.8 cM范围内.受恢复基因或不育胞质的影响,在花蕾4个发育时期,大部分基因表达存在明显差异.[结论]本研究获得了与恢复基因紧密连锁的SSCP标记,并初步了解了目标区间内部分基因的表达模式,为进一步开展恢复基因精细定位和候选基因的筛选提供了基础.