基于大量ChIP数据集的果蝇顺式调控模块的从头预测

• 作者: 张少强 李婷
• 来源期刊: 天津师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: ChIP数据集 果蝇 顺式调控模块 模体 FisherNet CLIMP
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 信息与计算机科学
• 页码范围: 73-76
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 2855字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19638/j.issn1671-1114.20180215

摘要

通过整合果蝇已有的ChIP数据集,采用模体发现算法FisherNet及高性能并行的模体聚类算法CLIMP对果蝇的顺式调控模块进行从头预测.与已知的顺式调控模块进行比对分析,结果表明该方法预测结果覆盖了数据集中已知顺式调控模块的82.93％,证明该方法具有一定的普适性.与较新的DePCRM算法进行比较,结果表明本算法在从头预测顺式调控模块上速度更快、精度更高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张少强	天津师范大学计算机与信息工程学院	13	15	3.0	3.0
2	李婷	天津师范大学计算机与信息工程学院	7	3	1.0	1.0