黄梁木实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

• 作者: 包钰韬 张梦洁 张登 徐武云 李景剑 杨霄 欧阳昆唏 陈晓阳
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: 黄梁木 实时荧光定量PCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 829-839
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB18003

摘要

为筛选黄梁木(Neolamarckia cadamba)实时定量PCR最佳内参基因,该研究以黄梁木的根、芽、叶、花、果、皮及形成层为材料,利用RT-qPCR技术对ACT、CAC、CYP和EF1α等21个管家基因家族43个候选内参基因进行表达量分析,并利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析.geNorm的分析结果显示,UPL基因的稳定性最高(M=0.443),UBQ基因的稳定性最低(M=2.859);NormFinder的分析结果显示,UPL基因的稳定性最高(E=0.223),UBQ基因的稳定性最低(M=4.759);BestKeeper分析显示,UPL基因的标准偏差(SD=0.513)最低.研究结果表明,UPL基因作为内参基因稳定性最高,UBQ基因的稳定性最低.因此可以选择UPL基因作为黄梁木不同组织中RT-qPCR定量分析的内参基因.