微囊藻群体总RNA提取方法的比较

• 作者: 卢亚萍 孔繁翔 张小倩 施丽梅 高胜玲 黄亚新
• 来源期刊: 湖泊科学
• 关键词: 微囊藻群体 RNA提取 qPCR 多糖
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 441-448
• 页数: 8页
• 字数: 6533字
• 语种: 中文
• DOI: 10.18307/2018.0215

摘要

微囊藻群体富含多糖类物质是影响微囊藻RNA提取的关键因素.为了获得高质量的微囊藻群体总RNA,对比分析4种针对多糖含量较高的方法——方法1 PGTX-bead法、方法2 CTAB-bead法、方法3 FastRNA(R) Pro Blue Kit和方法4RNeasy Mini Kit对微囊藻群体总RNA的提取效果.采用琼脂糖凝胶电泳检测微囊藻群体RNA的完整性,NanodropND1000分光光度计检测RNA纯度及浓度,并采用qPCR检测DNA污染情况.结果表明,4种方法都能从微囊藻群体中提取获得RNA,并在去除DNA后都可以进行RT-PCR等后续实验.方法1 PCTX-bead提取的RNA产量最高,纯度好,DNA污染小,成本低,适合从微囊藻群体中大量提取RNA;方法2 CTAB-bead提取的RNA样品产量也较高,但DNA污染严重,适合需要同时提取DNA和RNA的样本;方法3 FastRNA(R)Pro Blue Kit和方法4 RNeasy Mini Kit提取的RNA产量都较低,但方法4操作简单,耗时短,所检测目的基因的相对表达量较高,更适合从少量的微囊藻群体中提取总RNA.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孔繁翔	中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室	83	2479	27.0	47.0
2	卢亚萍	南京农业大学生命科学学院	19	127	7.0	11.0
3	黄亚新	南京农业大学生命科学学院	3	4	1.0	2.0
4	张小倩	南京农业大学生命科学学院	4	14	3.0	3.0
5	高胜玲	南京农业大学生命科学学院	2	3	1.0	1.0
9	施丽梅	中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室	3	5	2.0	2.0