绿翅短脚鹎线粒体基因组测序分析

• 作者: 吴少彬 周闯 宋旭颢 岳碧松 张文博 陈映竹 陈本平
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 雀形目 绿翅短脚鹎 线粒体基因组 控制区
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 基础资料
• 页码范围: 646-652
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.7|Q731
• 字数: 3354字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20180121

摘要

本文对绿翅短脚鹎Ixos mcclellandii线粒体基因组进行了测序分析.结果显示,绿翅短脚鹎线粒体基因组序列全长17 838 bp(GenBank登录号:KX640824),具有2个开放阅读框重叠区,即ATP6 ～ ATP8(10 bp)和ND4L～ND4(7 bp),还有一些重叠发生在蛋白质基因和其相邻的tRNA基因之间.除COXⅠ、ND3的起始密码子分别为GTG、ATA外,其余11个蛋白质基因的起始密码子均为ATG.9个蛋白质基因以TAA、AGA或AGG为终止密码子,其余则以T(COXⅢ和ND4)或TA(ND2和ND4L)为终止密码子.蛋白质基因使用频率最高的密码子是CUA(217次)和ACC(205次),而GGU和GCG的使用频率最低,均为24次.tRNA基因分布在rRNA基因和蛋白质基因之间,长度为64 ～75.bp.通过分析已报道的雀形目Passeriformes鸟类线粒体控制区结构,发现了3种不同类型的控制区结构:1)仅存在1个控制区;2)有2个长度相近且序列高度相似的控制区;3)有2个高度异质的控制区.绿翅短脚鹎线粒体基因组含有2个高度相似的控制区(相似度91.6％),长度分别为1 116bp和1 144 bp,二者仅在控制区开始和末端部位的序列有所不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张文博	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	5	20	2.0	4.0
2	陈映竹	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	2	3	1.0	1.0
3	宋旭颢	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	周闯	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	3	4	1.0	2.0
5	吴少彬	长江师范学院生命科学与技术学院	1	0	0.0	0.0
6	岳碧松		2	48	1.0	2.0