沙田柚乙烯应答因子的鉴定和生物信息学分析

• 作者: 李惠敏 李璐璐 秦新民 罗琼 陈玉梅
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 沙田柚 乙烯转录因子基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺园林
• 页码范围: 21-25,53
• 页数: 6页
• 分类号: Q946
• 字数: 3159字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19386/j.cnki.jxnyxb.2018.09.05

摘要

利用高通量测序对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚乙烯应答因子基因序列.采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析.该基因全长为1013 bp(GenBank登录号为MG905213),开放阅读框(ORF)全长498 bp,编码的蛋白质含166个氨基酸.编码蛋白质的相对分子量为18.45 kDa,理论等电点为7.90.该蛋白质具有一个与AP2 superfamily蛋白相同的保守结构域,为亲水性非分泌不稳定蛋白,不属于跨膜运动,共有24个可能的磷酸化位点.氨基酸序列分析表明,该基因编码的蛋白质与芸香科的甜橙(Citrus sinensis,XP-006467696.1)和克莱门柚(Citrus clementina,XP-006449381.1)的AP2蛋白的同源性分别为100％和98％.系统进化树表明,沙田柚的乙烯应答转录因子与甜橙和克莱门柚亲缘关系很近,属于同一进化分支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦新民	广西师范大学生命科学学院	74	526	13.0	17.0
2	李惠敏	广西师范大学生命科学学院	35	250	10.0	15.0
3	陈玉梅	广西师范大学生命科学学院	9	10	1.0	3.0
4	李璐璐	广西师范大学生命科学学院	9	3	1.0	1.0
5	罗琼	广西师范大学生命科学学院	4	0	0.0	0.0