普通烟草DHQ-SDH基因家族分析

• 作者: 张其东 张小全 张林 李正风 李锋 汪洪焦 王中 王燃 祁超亚 谢小东 贾云祯 金立锋 韦凤杰 魏攀
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 工学
• 关键词: 普通烟草 DHQ-SDH基因 基因家族 进化分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 烟草农学
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: TS413
• 字数: 4623字
• 语种: 中文

摘要

为明确DHQ-SDH基因在普通烟草中的功能,用拟南芥DHQ-SDH基因检索烟草基因组数据库,获得普通烟草DHQ-SDHs基因.利用生物信息学分析了NtDHQ-SDHs的基因结构、蛋白质特征、启动子顺式作用元件和基因进化,用qPCR检测了NtDHQ-SDHs的组织特异性表达.结果表明:普通烟草中有8个DHQ-SDHs基因.NtDHQ-SDHs的编码序列在1 248～1 608 bp之间,编码415～535个氨基酸,蛋白质分子量为45.13～58.22 kD,均为稳定蛋白.NtDHQ-SDHs的外显子和内含子数量相对保守,均含有8～10个外显子和7～9个内含子.基序组成和进化分析发现,8个NtDHQ-SDHs被分为2个亚家族,分别来源于普通烟草的两个祖先种(林烟草和绒毛状烟草).NtDHQ-SDHs在普通烟草根、茎、叶和顶芽中都有表达.