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荔枝蒂蛀虫信息素结合蛋白基因序列及表达分析
荔枝蒂蛀虫信息素结合蛋白基因序列及表达分析
作者:
刘艳萍
孙海滨
彭刚
李鹏燕
柏建山
王思威
龚雪海
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
荔枝蒂蛀虫
信息素结合蛋白
基因克隆
序列分析
软件模拟
表达谱
摘要:
[目的]获得荔枝蒂蛀虫Conopomorpha sinensis3个信息素结合蛋白(PBP)基因的全长序列,并分析序列和表达特征,为更好地利用性信息素防治该虫提供必要的基础.[方法]提取荔枝蒂蛀虫触角总RNA,利用转录组测序结果和RACE-PCR技术获得3个PBP基因的全长序列;对序列进行生物信息学分析,用I-TASSER在线软件建立蛋白三维模型,用TM-align软件进行同源建模,用COACH软件推测蛋白的结合位点;用荧光定量PCR方法分析这3个基因在不同龄期(幼虫和蛹)和3日龄雌雄成虫不同组织[触角、头(去除触角)、胸、腹、足和翅]中的表达谱.[结果]从荔枝蒂蛀虫触角中克隆了3个PBP基因的全长序列,分别命名为CsinPBP1,CsinPBP2和CsinPBP3(GenBank登录号:MF093145,MF093146和MF093147).序列分析结果表明,这3个基因的编码蛋白具有昆虫气味结合蛋白的典型特征,并且CsinPBP1与紫色卷蛾Yponomeuta cagnagellus PBP的氨基酸序列一致性达72%,CsinPBP2与小菜蛾Plutella xylostella PBP1的氨基酸序列一致性达55%,CsinPBP3与水稻大螟Sesamia inferens PBP3的氨基酸序列一致性达39%.软件模拟分析表明,CsinPBP1,CsinPBP2和CsinPBP3蛋白的三维结构分别与家蚕Bombyxmon普通气味结合蛋白2(GOBP2)(PDB:2wc6A)、脐橙螟Amyetois transitetella PBP1(PDB:4inxA)和家蚕PBP(PDB∶2p70A)相似度最高,分别预测得到10,7和8个结合位点.表达谱分析显示,3个基因均只在成虫触角中表达,在幼虫期和蛹期不表达,在成虫头(去除触角)、胸、腹、足和翅中也不表达,且在雄虫触角中的表达量分别是雌虫中表达量的1.94,28.19和32.94倍.[结论]获得荔枝蒂蛀虫3个PBP基因的全长序列,序列和表达分析结果提示这3个基因与雄虫感受性信息素有关.
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篇名
荔枝蒂蛀虫信息素结合蛋白基因序列及表达分析
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
荔枝蒂蛀虫
信息素结合蛋白
基因克隆
序列分析
软件模拟
表达谱
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
527-536
页数
10页
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
10.16380/j.kcxb.2018.05.002
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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