平欧杂种榛钙调蛋白基因ChaCaM的克隆与表达分析

• 作者: 朱利泉 李清 杨丹 梁丽松 王贵禧 赵天田 马庆华
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 平欧杂种榛 钙调蛋白基因 自交不亲和 生物信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1347-1358
• 页数: 12页
• 分类号: S664.4|Q781
• 字数: 8426字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0267

摘要

以平欧杂种榛(Corylus heterophylla×C.avellana)品种‘达维’为材料,基于转录组测序数据,利用RACE技术克隆钙调蛋白基因,通过生物信息学进行序列预测分析,并利用实时荧光定量PCR技术分析其在不同组织和自交不亲和授粉后不同时间雌蕊中的表达模式.克隆获得一个钙调蛋白基因序列,命名为ChaCaM(GenBank登录号:KY211037),其开放阅读框为450 bp,编码149个氨基酸,分子量16.8476kD.生物信息学分析表明,ChaCaM为酸性稳定蛋白,属于疏水性蛋白,无跨膜域和信号肽存在,主要定位于细胞质基质中,存在糖基化和磷酸化位点.序列分析表明,ChaCaM包含两个EFh结构域,与其他物种的CaM高度相似.系统进化树表明,ChaCaM与烟草、可可和萝卜等的CaM亲缘关系极近,聚类在同一分支下.基因表达分析表明,ChaCaM在平欧杂种榛不同组织中的表达具有差异,且在自交不亲和授粉后的雌蕊中具有明显的表达量变化.ChaCaM具有典型的钙调蛋白基因特征,主要定位于细胞质基质中;表现为组成型表达,推测其参与了榛属植物的自交不亲和反应.