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广西主要养殖区内逃逸尼罗罗非鱼线粒体D-loop控制区序列分析
广西主要养殖区内逃逸尼罗罗非鱼线粒体D-loop控制区序列分析
作者:
李文红
管嘉俊
郑惠芳
郭忠宝
韩卓君
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
广西
尼罗罗非鱼
线粒体DNA
D-loop
逃逸
摘要:
为研究广西主养区域逃逸罗非鱼的遗传多样性,本研究对广西玉林、南宁、钦州、贵港、防城港、北海的六个地理群体的尼罗罗非鱼线粒体D-loop序列进行了分析比较.通过聚合酶链式反应(PCR)和测序,获得了广西玉林、南宁、钦州、贵港、防城港、北海等六个地理群体的尼罗罗非鱼线粒体D-loop序列,采用序列比对和构建系统进化树等生物信息学分析方法探讨了不同地区尼罗罗非鱼线粒体D-loop的多样性.测序结果表明,在得到的线粒体D-loop区序列中,四种碱基A、G、T、C的平均比例分别为32.05%、20.79%、33.19%和13.97%,其中碱基C含量最低,碱基T含量最高.C+G(34.75%)的含量明显低于A+T(65.25%)的含量.共检测到140个变异位点,其中转换为79个,颠换为42个,19个插入(缺失)位点.碱基替换与插入(缺失)的比为6.39.在所测得的罗非鱼D-loop序列中成功识别保守序列CSB-2,CSB-3和相似序列CSB-1.系统进化分析表明,南宁地区罗非鱼的遗传距离值相对其它地区的遗传距离值较小,序列与参考序列最为接近,说明该区域罗非鱼的遗传分化程度最低;钦州地区逃逸尼罗罗非鱼的遗传距离相对其它地区间遗传距离值较远,在系统发育树中钦州地区罗非鱼也聚为整一小枝,说明钦州地区罗非鱼较其它区域有明显的遗传分化.
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篇名
广西主要养殖区内逃逸尼罗罗非鱼线粒体D-loop控制区序列分析
来源期刊
激光生物学报
学科
农学
关键词
广西
尼罗罗非鱼
线粒体DNA
D-loop
逃逸
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
451-459
页数
9页
分类号
S965.125
字数
5167字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1007-7146.2018.05.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
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1
郑惠芳
广西大学动物科学技术学院
26
121
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3
李文红
广西大学动物科学技术学院
37
174
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5
郭忠宝
30
152
7.0
11.0
8
管嘉俊
广西大学动物科学技术学院
1
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韩卓君
广西大学动物科学技术学院
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研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
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激光生物学报
主办单位:
中国遗传学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-7146
CN:
43-1264/Q
开本:
16开
出版地:
长沙市湖南师范大学生命科学学院内
邮发代号:
42-194
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2554
总下载数(次)
4
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