基于重测序开发的InDel标记定位陆地棉矮化突变体

• 作者: 何守朴 季高翔 杜雄明 潘兆娥 王朋朋 王立如 耿晓丽 贾银华 龚文芳
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 InDel 矮化 定位
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 448-454
• 页数: 7页
• 分类号: S562.024|Q343.1+7
• 字数: 4309字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/1002-7807.jgxdxm.20181121

摘要

[目的]利用重测序开发的InDel标记实现陆地棉矮化突变体基因AS98的定位.[方法]利用1个极端矮化材料AS98与其野生型LHF 10构建F2群体,根据突变体及其野生型的重测序数据开发InDel标记,并利用新开发的分子标记对矮化性状进行定位.[结果]挑选新开发的位于初步定位区间内的InDel标记114对,用2个材料进行标记多态性检测,筛选出具有多态性的标记20对;利用多态性标记在包含223个单株的F2群体中进行聚合酶链式反应,结合表型把矮化基因AS98定位于染色体D12上,与其最近的分子标记是InDel-50,遗传距离为6.9 cM.[结论]本试验证实了利用重测序数据开发InDel标记,并在陆地棉矮化材料衍生的分离群体中进行基因定位的可行性,为进一步精细定位及分子辅助选择育种提供参考.