炎症性肠病相关结肠癌组织差异表达基因的筛选及验证

• 作者: 余一祎 侯英勇 刘天舒 崔越宏 徐晓晶 王志明
• 来源期刊: 中国临床医学
• 学科: 医学
• 关键词: 炎症性肠病 结直肠恶性肿瘤 新一代测序 免疫
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 391-395
• 页数: 5页
• 分类号: R735.3+5
• 字数: 3913字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12025/j.issn.1008-6358.2018.20180316

摘要

目的:探讨炎症性肠病相关结肠癌患者的肿瘤组织及癌周组织的基因表达差异.方法:收集2016年1月至6月经术后病理学确诊为结肠腺癌合并克隆恩病或溃疡性结肠炎3例患者的石蜡包埋组织(FFPE);采用Illumina Hiseq平台对3例患者肿瘤组织和癌周组织进行测序,分析基因表达差异,并进行Pathway功能分类和富集分析;采用炎症性肠癌动物组织进行差异基因验证.结果:测序数据经过滤后,保存半年内的石蜡包埋组织标本的碱基含量分布及质量分布均符合分析要求,且样品间数据具有可比性.肿瘤组织和癌周组织间的差异表达基因涉及的通路集中于免疫性疾病、感染性疾病、信号转导等,其中富集最显著且包含差异基因最多的是原发性免疫缺陷相关通路.结论:炎症性肠病相关结肠癌的发生与免疫缺陷的关系最密切,其次为感染和信号转导通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯英勇	复旦大学附属中山医院病理科	109	788	13.0	24.0
2	崔越宏	复旦大学附属中山医院肿瘤内科	22	113	5.0	10.0
3	刘天舒	复旦大学附属中山医院肿瘤内科	75	595	14.0	22.0
4	王志明	复旦大学附属中山医院肿瘤内科	25	114	5.0	9.0
5	余一祎	复旦大学附属中山医院肿瘤内科	16	79	5.0	8.0
6	徐晓晶	复旦大学附属中山医院肿瘤内科	4	16	2.0	4.0