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二穗短柄草Bral基因的克隆及表达分析
二穗短柄草Bral基因的克隆及表达分析
作者:
刘瑶瑶
孙建中
李霞
武艳芳
王永丽
蒋建雄
高璐
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
二穗短柄草
阿魏酰基转移酶
基因克隆
表达特征
摘要:
植物阿魏酰转移酶(feruloyl transferase)是负责将阿魏酸从阿魏酰CoA转移至阿拉伯木聚糖分子上的关键酶之一,在阿拉伯木聚糖与木质素的连接上起到关键作用,因此与细胞壁抗降解屏障的形成密切相关.本研究以禾本科模式植物二穗短柄草(Brachypodium distachyon)为材料,通过qRT-PCR技术克隆得到了Bral(PlantGDB No.:5g 14720)基因的cDNA序列,其片段大小为1 369 bp.该基因的ORF编码443个氨基酸,蛋白质的理论分子质量为48.45 kD;基因原核表达以及蛋白质谱分析确定该基因的开放阅读框能正确编码蛋白,分子量大小与理论值基本一致.生物信息学分析显示该Bral蛋白的氨基酸序列中包含有BAHD酰基转移酶家族特有的HXXXD功能区以及DFGWG保守结构域,说明其是BAHD酰基转移酶家族的一个成员.对二穗短柄草基因组中89个BAHD酰基转移酶氨基酸序列的系统进化树分析发现,这89个酰基转移酶大致划分为4个大的亚族,每个大亚族又包含几个小的亚族,Bral蛋白(属于第Ⅰ亚族)与他人研究过的与香豆酸(p-coumalic acid,p-CA)代谢相关的阿魏酰基转移酶(属于第Ⅲ亚族)不属于同一亚族,其蛋白功能可能存在差异;同时,从89个蛋白的编码基因中选取了第Ⅲ亚族另外一个小亚族中的几个基因及与第Ⅲ亚族亲缘关系较远的第Ⅰ亚族的几个基因做了表达分析.qRT-PCR分析表明Bral基因与其他几个基因相比较,表达量高并且稳定,并且在二穗短柄草成熟期的茎、叶和幼穗等组织器官中的表达量约为其幼苗期的2倍,与二穗短柄草体内阿魏酸的积累特征基本一致,表明这个基因可能参与调控植物细胞壁中的阿魏酸(ferulic acid,FA)介导的交联反应.本研究的结果为该基因的生物学功能研究提供了资料,为禾本科能源植物开发利用和农作物秸秆的再生利用提供了新思路.
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篇名
二穗短柄草Bral基因的克隆及表达分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
二穗短柄草
阿魏酰基转移酶
基因克隆
表达特征
年,卷(期)
2018,(10)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
1678-1687
页数
10页
分类号
S188|Q812
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2018.10.005
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传播情况
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阿魏酰基转移酶
基因克隆
表达特征
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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