基于GEO数据库及生物信息学方法筛选食管癌放射抗拒关键基因及通路

• 作者: 何赟 崔颖涛 王中卫 王宝峰 郭亚 金迎迎 马红兵
• 来源期刊: 肿瘤预防与治疗
• 学科: 医学
• 关键词: 食管癌 放射抗拒 GEO 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 应用基础研究
• 页码范围: 242-247
• 页数: 6页
• 分类号: R735.1
• 字数: 4618字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0904.2018.04.002

摘要

目的:基于芯片数据采用生物信息学方法,寻找食管癌放射抗拒的关键分子及通路.方法:GEO数据库中下载食管癌放射抗拒mRNA表达谱芯片数据,使用Morpheus软件进行差异基因的统计学分析,利用生物信息学相关软件对这些基因进行生物学过程、信号通路及互做网络分析.结果:在GEO中获得GSE61686芯片数据,199个差异基因与食管癌放射抗拒相关,其中上调表达99个,下调表达100个.这些基因参与的生物学过程有代谢、刺激反应、细胞黏附、细胞再生及免疫过程.主要涉及23条信号通路.结论:利用生物信息学方法能有效分析基因芯片数据.食管癌放射抗拒的发生是多基因共同参与的结果,为寻找提高食管癌放射敏感性相关靶标提供新思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王宝峰	西安交通大学第二附属医院肿瘤科	16	132	6.0	11.0
2	马红兵	西安交通大学第二附属医院肿瘤科	42	166	8.0	10.0
3	王中卫	西安交通大学第二附属医院肿瘤科	36	184	8.0	11.0
4	金迎迎	西安交通大学第二附属医院肿瘤科	26	127	7.0	9.0
5	何赟	西安交通大学第二附属医院肿瘤科	6	14	3.0	3.0
6	郭亚	西安交通大学第二附属医院肿瘤科	4	8	2.0	2.0
7	崔颖涛	西安交通大学第二附属医院肿瘤科	7	37	3.0	6.0