基于线粒体16S rRNA、COX1和Cytb基因探讨11种小丑鱼的系统发育关系

• 作者: 何丽斌 吴孙龙 周宸 张河长 朱志煌 陈芳 马敏宁
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 16S rRNA基因 COX1基因 Cytb基因 小丑鱼 遗传差异 系统进化
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 230-235
• 页数: 6页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4661字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.03.003

摘要

采用线粒体16S rRNA、COX1和Cytb基因测定11种小丑鱼的序列,分析其基因序列差异和遗传距离关系,并用邻接法、最大似然法和贝叶斯法构建系统进化树,探讨了11种小丑鱼的系统发育关系.序列分析结果显示,经比对处理后的3个基因总长度4388 bp,其中多态位点1028个,简约信息位点616个,转换与颠换比为2.12,A+T的平均含量为54.7％,高于C+G的平均含量45.3％.系统发育关系表明:(1)双锯鱼亚科为单系发生,但双锯鱼属不为单系发生,建议对棘颊雀鲷属重新定位;在双锯鱼属中,公子小丑鱼Amphiprion ocellaris和黑边公子小丑鱼Amphiprion percula聚为一支,为双锯鱼亚科分子亲缘关系基础;(2)透红小丑鱼Premnas biaculeatus在双锯鱼属的定位较为模糊,贝叶斯树显示透红小丑鱼P.biaculeatus与公子小丑鱼A.ocellaris和黑边公子小丑鱼A.percula聚成一支并位于该支的底端,而NJ树和ML树中透红小丑鱼却没能和公子小丑鱼A.ocellaris和黑边公子小丑鱼A.percula聚为一支,而是和其他小丑鱼汇聚成一支;(3)透红小丑鱼P.biaculeatus与金透红小丑鱼Premnas epigrammata是同一种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何丽斌		18	149	6.0	12.0
2	周宸		32	339	7.0	18.0
3	朱志煌		11	21	3.0	4.0
4	马敏宁		2	0	0.0	0.0
5	张河长		2	0	0.0	0.0
6	吴孙龙		2	0	0.0	0.0
7	陈芳		1	0	0.0	0.0