基于GEO数据库的HPV阳性口咽癌特征基因生物信息学研究

• 作者: 张轶雯 方罗 楼倩雯 潘宗富 钟里科 黄萍
• 来源期刊: 中国现代应用药学
• 学科: 医学
• 关键词: HPV感染 口咽癌 差异基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 638-641
• 页数: 4页
• 分类号: R963
• 语种: 中文
• DOI: 10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2018.05.004

摘要

目的 通过分析HPV阳性与阴性口咽癌患者基因芯片数据,寻找差异基因及其关键通路,区分不同HPV感染状态下口咽癌的分子表达特征基因谱.方法 利用GEO数据库中高通量基因芯片数据库筛选出口咽癌患者具有HPV感染状态信息的芯片.采用GO基因功能注释和KEGG通路富集分析,筛选出可表征不同HPV感染状态口咽癌生物特性的特征基因簇和通路,并进行蛋白质相互作用网络可视化分析.结果 经差异基因分析后,发现HPV感染状态可影响口咽癌的生物学特征,并显著改变一些重要的肿瘤信号通路,如Wnt信号通路和PI3K-Akt信号通路等.结论 本研究利用生物信息学方法,从多种角度定义了口咽癌不同HPV感染状态下的分子表达特征,为口咽癌的精准治疗提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方罗		40	199	8.0	13.0
2	潘宗富		11	13	2.0	3.0
3	黄萍		28	22	3.0	4.0
4	张轶雯		17	13	2.0	3.0
5	钟里科		11	15	3.0	3.0
6	楼倩雯		2	0	0.0	0.0