MALDI-TOF MS与16SrDNA方法对肠杆菌科微生物鉴定比较分析

• 作者: 代晓航 刘炜 赵欢 郭灵安 魏超
• 来源期刊: 质谱学报
• 学科: 化学
• 关键词: 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS) 16SrDNA 肠杆菌科微生物 系统进化
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 209-215
• 页数: 7页
• 分类号: O657.63
• 字数: 3408字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7538/zpxb.2017.0020

摘要

为了研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法鉴定肠杆菌科微生物及其对微生物系统分类学相关分析的准确性,采用MALDI-TOF MS对金桔表面分离的10种肠杆菌科微生物进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现微生物的鉴定与系统进化学分析;同时对10种微生物进行16SrDNA提取与测序,得到分子生物化学水平鉴定,并采用邻近连接法对16SrDNA序列做系统进化树分析.结果表明:MALDI-TOF MS与16SrDNA测序对10种肠杆菌科微生物鉴定结果中,克雷伯菌属2株菌鉴定种级有偏差,其他8种一致;MALDI-TOF MS与16SrDNA测得的数据都可计算微生物相关性,从而得到微生物系统发育树,两株系统发育树中同属级微生物归类的亲缘位置与方向一致,但不同属肠杆菌科微生物的亲缘距离与位置差异较大.MALDI-TOF MS法鉴定农产品表面微生物具有快速 、准确的特点,但准确建立系统发育相关性还需要扩大数据库和优化算法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	代晓航	四川省农科院分析测试中心	30	157	7.0	11.0
2	郭灵安	四川省农科院分析测试中心	46	226	9.0	13.0
3	刘炜	四川省农科院分析测试中心	18	36	4.0	5.0
4	魏超	四川省农科院分析测试中心	20	46	4.0	6.0
5	赵欢	华西师范大学生命科学院	1	10	1.0	1.0