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剑麻与烟草疫霉互作过程中的转录组研究
剑麻与烟草疫霉互作过程中的转录组研究
作者:
周文钊
张燕梅
李俊峰
杨子平
赵艳龙
陆军迎
鹿志伟
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
剑麻
烟草疫霉
互作
转录组
摘要:
斑马纹病是剑麻的主要病害之一,为了挖掘剑麻斑马纹病抗病相关基因,以斑马纹病抗病品种热麻1号为材料,分别在接种0、24、36、48和72 h进行转录组测序,组装后获得103 326个转录本和70 1 10个Unigenes,转录本和Unigene的平均长度分别为726 bp和645 bp.其中有33 474个Unigenes被成功注释到NR,NT,KO,Swissport等7个功能数据库中.DEG分析表明,在接种24、36、48、72 h后分别有4 676、3 769、3 308、3 757个Unigenes被诱导差异表达,且PR蛋白,类黄酮生物合成、苯丙素类生物合成、过氧化物酶等基因上调表达明显,而热击蛋白、细胞色素P450和叶绿素a/b结合蛋白等基因明显下调表达.差异基因代谢通路分析表明,参与核糖体、光合作用、苯丙素类生物合成、苯丙氨酸代谢通路、植物激素信号转导途径、类黄酮生物合成途径、脂肪酸生物合成途径等代谢通路明显富集.本研究全面了解剑麻与烟草疫霉互作关系,是为剑麻斑马纹病抗病机制研究提供理论基础.
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文献信息
篇名
剑麻与烟草疫霉互作过程中的转录组研究
来源期刊
热带作物学报
学科
农学
关键词
剑麻
烟草疫霉
互作
转录组
年,卷(期)
2018,(3)
所属期刊栏目
作物病虫害及其防治、环境保护
研究方向
页码范围
540-546
页数
7页
分类号
S563.8
字数
5109字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2561.2018.03.021
五维指标
传播情况
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引文网络
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剑麻
烟草疫霉
互作
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带作物学报
主办单位:
中国热带作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-2561
CN:
46-1019/S
开本:
大16开
出版地:
海南省海口市龙华区学院路4号
邮发代号:
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
5760
总下载数(次)
12
总被引数(次)
35220
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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