低温胁迫下不同甘蔗品种的转录组比较分析

• 作者: 唐仕云 李杨瑞 杨丽涛
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 甘蔗 低温胁迫 转录组
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 116-124
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0522

摘要

对低温胁迫和常温处理的桂糖08-1180和ROC22进行转录组测序,比较不同甘蔗品种抗寒性分子机制的差异.结果表明:测序共产生57.41 G 的clean bases,拼接后获得183 515个unigenes,将获得的基因在NR、NT、Swiss-Prot、PFAM、KOG/COG、KEGG、GO数据库进行比对,有110 021个unigenes获得注释.低温胁迫下,桂糖08-1180有16 145个基因的表达发生了显著变化,ROC22有20 317个基因的表达发生了显著变化,且均表现为上调表达基因多于下调表达基因.ROC22与桂糖08-1180共有13 113个差异表达基因相同,ROC22特有7 204个差异表达基因,桂糖08-1180特有3 032个差异表达基因.对2个品种的共有差异表达基因进行富集分析,在对寒害逆境反应、膜系统、光合作用等的功能小类富集较多.对特有差异表达基因进行富集分析,桂糖08-1180在DNA整合、RNA聚合酶、ADP结合及代谢酶中富集较多,而ROC22在有机化合物的合成、运输和转运蛋白活性相关的条目富集得较多.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李杨瑞	广西农科院甘蔗研究所	29	454	11.0	20.0
3	杨丽涛		4	41	3.0	4.0
6	唐仕云	广西农科院甘蔗研究所	1	2	1.0	1.0