植物miR172家族成员进化与分子特性分析

• 作者: 倪珊珊 刘炜婳 林争春 林玉玲 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: miR172家族 进化规律 分子特性 二级结构 靶基因
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 525-533
• 页数: 9页
• 分类号: Q789
• 字数: 6005字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.03.019

摘要

为了解植物miR172家族成员的进化与分子特性,对miRbase数据库中37个物种的161个miR172前体序列和196个miR172成熟体序列进行进化规律分析,并对植物miR172家族的保守基序、二级结构和靶基因进行预测分析.结果表明:miR172家族成员分布的37个物种都是被子植物,被子植物很可能是miR172家族进化来源的祖先.进化分析表明,植物miR172家族成员序列相似性是其聚类的首要影响因素,其次才是物种差异的影响.植物miR172家族成员成熟体序列分析表明,5p臂上形成的成熟体序列特异性较大,3p臂上形成的成熟体序列保守性较高.二级结构分析发现,植物miR172家族成员具有典型的茎环二级结构,且茎序列的保守性较环序列高.植物miR172前体序列包含1个UNCG环.靶基因预测分析发现,同一物种不同miR172成员的靶基因可能不同;不同物种miR172的靶基因也可能不同,AP2或AP2-like出现频率最高,其次还有arginine decarboxylase 1、Pathogenesis-related、MYB84等靶基因,表明其靶基因功能的多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林争春	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	14	84	4.0	9.0
3	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
4	刘炜婳	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	10	23	3.0	4.0
5	倪珊珊	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	7	3	1.0	1.0