模拟微重力对大鼠甲状腺滤泡上皮细胞miRNA表达的影响

• 作者: 司少艳 吴继华 周金莲 宋淑军 崔彦 张倍宁 张建中 李考 郑冬 闫如意
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 模拟微重力 FRTL-5 miRNA 芯片杂交 功能富集分析
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 668-673
• 页数: 6页
• 分类号: R857
• 字数: 4303字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11855/j.issn.0577-7402.2018.08.08

摘要

目的 探讨微重力环境对大鼠甲状腺滤泡上皮细胞(FRTL-5)微小RNA(miRNA)表达的影响.方法 体外培养FRTL-5,随机分为模拟微重力(SMG)组和正常重力(NG)组,每组3个样本.SMG组采用旋转细胞培养系统(RCCS)模拟微重力环境,NG组于培养箱静置培养,24h后提取样本总RNA,进行荧光标记和芯片杂交.采用Feature Extraction软件处理杂交图像提取原始数据,应用Genespring软件进行分位数标准化和后续处理,筛选差异表达显著的miRNA,反转录实时定量PCR(RT-qPCR)验证芯片结果准确性.通过miRNA靶基因预测数据库TargetScan和microRNAorg对差异miRNA进行靶基因预测,以其交集作为潜在调节靶基因,对预测靶基因分别进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,判定差异miRNA主控的生物学过程和信号通路.结果 miRNA芯片检测发现,FRTL-5在模拟微重力环境下与正常重力环境下差异表达的miRNA有81个,其中53个显著上调,28个显著下调,差异表达最显著的3条,包括显著下调的rno-let-7b-3p、rno-miR-346(P＜0.05),以及显著上调的rno-miR-494-3p(P＜0.05),对其芯片结果进行RT-qPCR验证,结果相一致.GO分析显示,差异表达的miRNA与细胞老化、凋亡、对低氧的反应、转录等生物学过程相关;KEGG分析显示,差异表达的miRNA与低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、环磷酸鸟苷-蛋白激酶G(cGMP-PKG)信号通路、叉头框转录因子O(FoxO)信号通路及多种甲状腺激素调节通路相关.结论 微重力环境下大鼠甲状腺滤泡上皮细胞相关miRNA表达发生显著变化,基于芯片技术的miRNA靶基因预测和功能富集分析可为甲状腺失重应激反应、损伤及修复措施的探讨提供理论参考.