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感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析
感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析
作者:
侯茂林
刘玉娣
王香萍
邓瑶
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
白背飞虱
唾液腺
南方水稻黑条矮缩病毒
转录组
差异表达基因
摘要:
[目的]白背飞虱Sogatella furcifera是南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)传播的主要介体,其唾液腺在取食和传毒的过程中都发挥着重要作用,本研究旨在通过对带毒与不带毒白背飞虱成虫的唾液腺进行转录组测序,进而比较分析找出差异表达基因,推测出唾液腺中与传毒相关的基因.[方法]利用Ion ProtonⅡ,PGM平台进行带毒与不带毒白背飞虱成虫唾液腺转录组测序,用SOAPdenovo软件从头组装,通过blastX比对进行基因注释.采用Blast2go和Blastall软件对所测基因的GO功能富集和KEGG代谢途径进行分析;采用RPKM分析差异表达基因.[结果]带毒和不带毒白背飞虱的唾液腺转录组样本的原始数据经过软件处理后分别获得52 062和51 407条unigenes序列(GenBank登录号分别为SRS851833和SRS843978),平均长度分别为639和647 bp.通过NR数据库比对,共18 431个unigenes具有同源序列,与赤拟谷盗Tribolium castaneum的同源序列最多(16.23%).所有unigenes富集到52个GO类群,240个KEGG信号通路.白背飞虱在感染南方水稻黑条矮缩病毒后,唾液腺有89个unigenes序列的表达发生变化.[结论]本研究通过比较分析带毒与不带毒白背飞虱唾液腺转录组样本后,发现有部分基因序列的表达存在差异,这些基因序列可能和病毒与载体的互作有关.转录组数据的获得为研究与取食和传毒相关的基因提供了有用的信息,从而在分子水平上为后续研究白背飞虱与SRBSDV互作机制奠定基础.
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文献信息
篇名
感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
白背飞虱
唾液腺
南方水稻黑条矮缩病毒
转录组
差异表达基因
年,卷(期)
2018,(4)
所属期刊栏目
病理与微生物
研究方向
页码范围
449-457
页数
9页
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
10.16380/j.kcxb.2018.04.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王香萍
长江大学农学院昆虫研究所
38
130
6.0
9.0
2
侯茂林
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
24
452
11.0
21.0
3
刘玉娣
长江大学农学院昆虫研究所
10
98
6.0
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5
邓瑶
长江大学农学院昆虫研究所
2
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二级引证文献(1)
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引证文献(1)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
白背飞虱
唾液腺
南方水稻黑条矮缩病毒
转录组
差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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