去势抵抗性前列腺癌差异表达基因及其关键通路的生物信息学分析

• 作者: 张维涛 方东 王世霞 王文刚 王鹏 程川
• 来源期刊: 现代泌尿外科杂志
• 关键词: 去势抵抗性前列腺癌 生物信息学 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 539-544
• 页数: 6页
• 分类号: R73
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-8291.2018.07.014

摘要

目的 研究去势抵抗性前列腺癌(CRPC)内分泌治疗耐药的分子机制,并寻找去势抵抗性前列腺癌的潜在治疗靶点,为临床对前列腺癌患者的诊疗提供新的方向.方法 在NCBI的公共基因芯片表达谱数据库(GEO)中提取前列腺癌相关基因芯片数据,利用GEO2R在线分析工具进行数据挖掘,筛选出去势抵抗性前列腺癌及激素敏感性前列腺癌的差异表达基因(DEGs),并利用DAVID在线分析软件对上述基因数据进行相关基因功能富集分析.同时,通过String、Cytoscape等生物信息学分析工具构建蛋白相互作用网络模型.结果 按照基因差异表达倍数＞1.5,P＜0.01的筛选条件,筛选出差异基因270个,其中上调表达基因141个和下调表达基因129个.对差异基因编码的蛋白质间的相互作用进行网络绘制,发现这些基因编码的蛋白间的相互作用主要集中在TOP2A、CDK1、BIRC5、BUB1、AURKA、FOXM1、DCN、EZH2、TYMS、ASPM等关键节点基因.最后对重要节点基因进行文献挖掘,发现这些基因可能与前列腺癌的耐药和转移有关.结论 利用生物信息学方法对去势抵抗性前列腺癌及激素敏感性前列腺癌的差异表达基因的分析,可有效发掘这些差异表达基因的相互作用信息,为去势抵抗性前列腺癌的早期诊断及治疗靶点选择提供了新的线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程川	泰山医学院附属医院泌尿外科	23	30	3.0	4.0
2	张维涛	泰山医学院附属医院泌尿外科	6	14	3.0	3.0
3	王鹏		20	27	3.0	4.0
4	王文刚		2	1	1.0	1.0
5	方东		2	1	1.0	1.0
6	王世霞		1	1	1.0	1.0