基于高通量测序的不同产地和部位自然醇化片烟真菌群落结构分析

• 作者: 何伟 包可翔 张瑞强 李菁菁 林俭 范坚强 陈义强 陈善义 陈少滨
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 工学
• 关键词: 片烟 自然醇化 真菌 MiSeq ITS 群落结构
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 烟草农学
• 页码范围: 12-19
• 页数: 8页
• 分类号: TS444
• 字数: 4983字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16135/j.issn1002-0861.2017.0270

摘要

为探明仓储自然醇化片烟真菌的群落多样性,采用MiSeq高通量测序技术对云南沾益、贵州长顺、福建尤溪、河南确山的上、中、下3个部位共12份自然醇化片烟样品中真菌ITS进行分析.结果表明:①12份样品共获得1155个操作分类单元(Operational taxonomic unit,OTU),真菌群落丰富度和多样性最高的样品分别是福建尤溪B2F和C3F自然醇化片烟.②12份样品的优势菌门均为子囊菌门(Ascomycota).云南沾益C3F、X2F自然醇化片烟优势菌属为茎点霉属(Phoma);河南确山B2F、C23F、X2F自然醇化片烟优势菌属为链格孢属(Alternaria);贵州长顺X23F自然醇化片烟的优势菌属为Monographella;其余6份样品的优势菌属均为曲霉属(Aspergillus).③上、中、下部叶4个产地共有的OTU个数分别为121、79、168个,共有OTU的reads数占各样品OTU总reads数的70%以上(除福建尤溪C3F外),同一部位不同产地自然醇化片烟真菌群落结构差异主要体现在优势菌属的占比方面.