秦川牛TRAF6基因多态及其与体尺性状的关联分析

• 作者: 党瑞华 张芷毓 李世鹏 樊英智 欧德琼 赖振雨 邬明丽 雷初朝 高源
• 来源期刊: 中国牛业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 秦川牛 TRAF6基因 SNP 限制性酶切片段长度多态性 体尺性状
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 科学试验
• 页码范围: 4-8
• 页数: 5页
• 分类号: S823
• 字数: 3635字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-9111.2018.04.002

摘要

牛TRAF6基因位于15号染色体上,含有七个外显子,共编码902个氨基酸,是生长发育相关的候选基因.本研究旨在分析陕西地区秦川牛TRAF6基因多态及其与体尺性状之间的关系.本研究针对秦川牛TRAF6基因外显子及部分非编码序列设计引物,利用DNA池做为模板扩增测序,在第六内含子17 628 bp处发现1个SNP.通过运用PCR-RELP方法对该位点多态进行分析,结果发现存在2种基因型,分为TT和TC.TT的基因型频率为0.9574,TC的基因型频率0.0426;等位基因T的频率为0.9787,等位基因C的频率为0.0213,TT的基因型频率显著高于基因型TC,为优势基因型,TT基因型个体各体尺性状数据普遍高于TC基因型个体.本研究首次对陕西地区秦川牛的TRAF6基因进行了多态性分析,在第六内含子处发现了基因突变位点,且该突变位点与秦川牛体尺和体重等重要生长性状有关,可以作为分子标记辅助选择的参考.