马MC1R基因多态位点与毛色相关性分析

• 作者: 刘庆友 李志鹏 李桢 潘庆杰 石德顺 肖宁 赵珊珊
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马 毛色 MC1R基因 多态位点
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1605-1616
• 页数: 12页
• 分类号: S821.2
• 字数: 7492字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.08.005

摘要

旨在研究马MC1R基因多态位点与马毛色的关联性,为马的毛色育种提供重要的理论参考依据.本研究采集了10种不同毛色共132匹马的颈静脉血,提取基因组并应用PCR技术克隆MC1R基因编码序列,通过限制性长度多态性(RFLP)分析和测序分析,对马MC1R基因多态性与毛色进行关联分析,并预测了SNPs对其编码蛋白结构的影响.构建和分析了MC1R基因的系统发育树.结果发现,马MC1R基因存在3个多态位点,其中c.G102A为同义突变,c.C248T和c.G250A为错义突变.c.C248T造成MC1R蛋白的第83个氨基酸由极性亲水丝氨酸变为非极性疏水苯丙氨酸,预测突变后该位点氨基酸与第三跨膜区的第127个氨基酸(丝氨酸)之间的氢键消失而改变了MC1R的蛋白构象,该突变导致MC1R基因出现EE、Ee和ee 3种基因型.错义突变c.G250A导致其翻译的氨基酸由天冬氨酸变为天冬酰胺,该位点突变后与邻近氨基酸及跨膜域作用力复杂,推测比只出现c.C248T突变对MC1R蛋白功能的影响要小,该位点突变导致出现基因型eea.综合NCBI中的马MC1R基因型数据(共571匹)与其毛色性状进行相关性分析发现,在骝毛马和黑毛马群体中存在EE和Ee两种基因型,青毛马群体中存在EE、Ee、ee和eea基因型,栗毛中存在ee和eea两种基因型.黑毛和骝毛马的基因型分布差异极显著(P＜0.01),呈现Hardy-Weinberg不平衡,等位基因E为优势等位基因;在栗色马中未检测到E等位基因,e为优势等位基因.MC1R基因系统发育树分析显示,EE基因型个体与家马、普氏野马相似性最高.本研究结果显示,马MC1R多态位点产生的不同基因型与马的骝毛、黑毛、栗毛及以这3种毛色为基础毛色的花马毛色存在相关性,骝毛马与黑毛马中不存在基因型ee,栗毛马中则不存在等位基因E.为应用基因型对马的毛色进行定向选择育种奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石德顺	广西大学亚热带生物资源保护与利用国家重点实验室	241	1058	14.0	21.0
2	刘庆友	广西大学亚热带生物资源保护与利用国家重点实验室	54	200	7.0	11.0
3	李桢	青岛农业大学动物科技学院	32	126	6.0	10.0
4	潘庆杰	青岛农业大学动物科技学院	69	286	8.0	13.0
5	李志鹏	广西大学亚热带生物资源保护与利用国家重点实验室	8	12	2.0	3.0
6	赵珊珊	广西大学亚热带生物资源保护与利用国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
7	肖宁	广西大学亚热带生物资源保护与利用国家重点实验室	1	1	1.0	1.0