rDNA-ITS序列分析法鉴定桑椹菌核病病原菌

• 作者: 刘刚 危玲 夏川林 曾益春 曾贞 朱洪庆 殷浩 王香君 黄盖群
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: rDNA-ITS 测序 桑椹菌核病病原菌 鉴定
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 962-967
• 页数: 6页
• 分类号: Q939.5|S888.71+9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13441/j.cnki.cykx.2018.06.020

摘要

采集四川南充、绵阳、乐山等地果桑园中的真菌12株,利用ITS引物扩增并进行测序,构建系统进化树,分析12个真菌样品与已知物种的亲缘关系.结果表明,12个真菌样品扩增出的目的条带长度为500 bp,j1、J2、J3、J4、J5、J7、J8、J12菌株与桑实杯盘菌(Ciboria shiraiana)的序列相似度最高,J6、J9菌株与小核盘菌(Sclerotinia minor)的序列相似度最高,J10菌株与肉阜状杯盘菌(Ciboria carunculoides)的序列相似度最高,J11菌株与桑椹核地杖菌(Scleromitula shiraiana)的序列相似度最高,且序列比对分析结果同传统形态学鉴定结果完全一致.2种方法相结合最终得出结论:J1、J2、J3、J4、J5、J7、J8、J12菌株为桑实杯盘菌;J6、J9菌株为小核盘菌;J10菌株为肉阜状杯盘菌;J11菌株为桑椹核地杖菌.与传统形态学鉴定法相比,rDNA-ITS序列分析法具有准确度高,不受真菌样品生长情况、地理环境影响等优点,可避免因形态特征掌握不足而导致的不确定性,2种方法相结合在真菌鉴定中会有更广泛、更深入的应用.