RNA质量对内参基因选择和qRT-PCR结果评价的影响

• 作者: 刘勤社 张琳萍 王海芳 赵向绒 霍雪萍
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: RNA纯度 实时荧光定量PCR 内参基因 肿瘤坏死因子α
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 415-418
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 2449字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2018.03.020

摘要

目的:研究RNA质量对内参基因选择和实时定量PCR(qRT-PCR)分析肿瘤坏死因子α(TNFα)诱导基因表达结果评价的影响.方法:用TNFα刺激体外培养的小鼠血管内皮细胞,采用qRT-PCR技术,以2种常用的管家基因β-actin和GAPDH为内参,检测细胞间黏附分子1(ICAM-1)基因的表达,探讨RNA纯度对TNFα下游基因表达检测结果的影响.结果:当提取的总RNA纯度很高(D260nm/D230nm＞2.0)时,以β-actin和GAPDH为内参基因检测ICAM-1基因表达的结果相近;当总RNA可能被盐及小分子污染(D260nm/D230nm＜2.0)时,以β-actin为内参基因检测的ICAM-1基因相对表达量显著高于以GAPDH为内参所得结果.结论:RNA质量显著影响荧光定量PCR对基因表达的检测结果,因此在RNA质量较低时应选择2个或以上内参基因进行校正,以减少实验结果误差,得到准确结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵向绒	陕西省人民医院中心实验室	14	70	4.0	8.0
2	霍雪萍	陕西省人民医院中心实验室	8	23	3.0	4.0
3	刘勤社		5	11	2.0	3.0
4	王海芳		4	5	1.0	2.0
5	张琳萍	西安交通大学医学部	2	10	2.0	2.0