运用数字PCR检测乳腺癌组织FFPE样品中人表皮生长因子受体2拷贝数的变化

• 作者: 付洁 宋海峰 张晶 王哲 王芳 石怀银 董周寰 许程程
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 人表皮生长因子受体2 拷贝数变异 数字PCR 福尔马林固定石蜡包埋样品
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 409-414
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 3435字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2018.03.019

摘要

目的:建立数字PCR(ddPCR)法检测乳腺癌福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片样品中人表皮生长因子受体2(HER2)的拷贝数变化(CNV),并与免疫组化(IHC)、荧光原位杂交(FISH)结果比较,以寻求更客观、准确、通量的肿瘤标志物检测方法.方法:以细胞系293T、HOEC、SKOV3基因组DNA(gDNA)为模板,对靶基因HER2及校正基因CEP-17建立双通道ddPCR检测法,并对21例IHC检测HER2阳性(++/+++)的乳腺癌FFPE样品进行CNV(HER2/CEP-17)检测,与IHC、FISH结果比较.结果:单、双通道法对HER2 CNV检测结果一致;细胞及临床样品检测结果表明,ddPCR检测HER2 CNV的阴性、阳性Cut-off值分别为1.2、2.1,中间值为1.2～2.1.14例FISH阴性标本中,ddPCR的一致性为93％(13/14);3例IHC“+++”的样品中,FISH检测均为阳性,2例ddPCR检测为阳性,1例(17#)检测临界阳性.2例IHC“++”的样品,FISH检测阳性,但ddPCR检测为阴性.结论:ddPCR能检测样本HER2 CNV,且与FISH结果判读部分一致,具有临床应用前景,但仍需大量样品来进行验证及建立结果判断标准.