柯萨奇病毒B组4型河南分离株全基因组序列分析

• 作者: 卫海燕 王海霞 许玉玲 马红霞 黄学勇
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 柯萨奇病毒B组4型 基因组 遗传进化
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 33-38
• 页数: 6页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2018.0003

摘要

目的 了解河南省手足口病病原柯萨奇病毒B组4型(coxsackievirus B4,CV-B4)全基因组特征,分析不同疾病来源CV-B4病毒分离株VP1区基因异同.方法 对采集的手足口病患者临床标本134份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;对其中1株分离株通过4对引物分段扩增,拼接CV-B4分离株基因组序列,用生物信息学软件分析,构建序列遗传树.结果 测序获得河南省CV-B4分离株HN23/ CB4/CHN/2013基因组全长序列7 394 bp,5'非编码区(5'-UTR)、P1、P2、P3、3'非编码区(3'-UTR)区域核苷酸序列与GenBank公布的其他分离株相似性分别为80.3％～95.7％、80.8％～93.9％、78.6％～87.7％、78.1％～81.2％和66.7％～87.5％;VP1区核苷酸相似性为81.2％～93.2％,氨基酸相似性为96.1％～99.3％,与糖尿病患者分离株E2核苷酸差异最大,达28.8％,与手足口病分离株差异最小,为6.8％.结论 CV-B4病毒同种疾病分离株VP1区域核苷酸同源性较高,不同疾病分离株差异性较大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马红霞	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室	17	76	5.0	8.0
2	黄学勇	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室	93	505	10.0	17.0
3	许玉玲	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室	23	38	4.0	5.0
4	王海霞	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室	5	1	1.0	1.0
5	卫海燕	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室	20	62	5.0	7.0