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广西巴马小型猪SP1基因克隆测序及其真核表达载体的构建
广西巴马小型猪SP1基因克隆测序及其真核表达载体的构建
作者:
兰干球
司景磊
夏攀杰
夏琴
崔悦悦
张广杰
李龙
邱庆庆
邹辉
原文服务方:
南方农业学报
广西巴马小型猪
SP1基因
克隆
真核表达载体
生物学信息分析
摘要:
[目的]克隆广西巴马小型猪特异性蛋白1(SP1)基因,并构建其真核表达载体,为揭示其对猪生长发育的调控机理打下基础.[方法]利用RT-PCR从广西巴马小型猪背最长肌组织中扩增SP1基因,采用DNASTAR、TMHMM等分别进行基因生物信息学分析;以pEGFP-N1质粒构建真核表达载体pEGFP-N1-SP1并转染293T细胞,于转染48 h后在倒置荧光显微镜下观察并拍照.[结果]克隆获得的广西巴马小型猪SP1基因与GenBank中野猪(Sus scrofa)的参考序列(XM_005652569.3)一致,未发现碱基突变位点;其编码序列(CDS)全长2340 bp,编码779个氨基酸.广西巴马小型猪SP1蛋白不存在跨膜结构,也不存在信号肽,不属于分泌型蛋白;其二级结构中α-螺旋占17.84%,延伸链占21.31%,β-转角占9.76%,无规则卷曲占51.09%.构建的真核表达载体pEGFP-N1-SP1能成功转染至293T细胞中并表达出绿色荧光蛋白.[结论]广西巴马小型猪SP1基因CDS序列编码蛋白主要参与细胞内活动,而非外分泌型蛋白,以SP1基因构建的真核表达载体pEGFP-N1-SP1能转染293T细胞并成功表达,可直接用于后期SP1基因功能探索及干扰表达等研究.
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文献信息
篇名
广西巴马小型猪SP1基因克隆测序及其真核表达载体的构建
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
广西巴马小型猪
SP1基因
克隆
真核表达载体
生物学信息分析
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
畜牧·兽医·水产·蚕桑
研究方向
页码范围
360-366
页数
7页
分类号
S828.89
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-1191.2018.02.24
五维指标
传播情况
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SP1基因
克隆
真核表达载体
生物学信息分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
总被引数(次)
43586
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